台湾交通大学、阳明大学于2021年合校，并同步在美国以缩写「NYCU」注册商标，但于商标登记公开展示期间，纽约大学（NYU）向阳明交大提出异议，认为两者缩写名称太像恐造成混淆。阳明交大表示，已将相关答复提交美国专利与商标局，目前正在等待裁定。
阳明交大校长林奇宏提交的声明指出，交通大学与国立阳明大学在2021年合并，阳明交通大学取自前身两校校名，缩写NYCU也取自两校英文校名开头字母，并冠上N（National）国立大学，阳明交大现有约2万1500名学生、75个研究中心，校区位于台湾台北与新竹。
另外，声明也强调，NYCU缩写已获得台湾教育部核准使用，在美申请商标是希望致力于推动全球教育，又阳明交大从未、也无意在美国提供大学课程，阳明交大是台湾的大学，目前也仅在台湾开课，但与美国14所教学研究机构签约合作，其中包括普渡大学、伊利诺大学厄巴纳-香槟分校、加州大学系统学校等。
林奇宏也在声明最后表示，阳明交大的同仁均感到惊讶，不能理解为何纽约大学会认为阳明交大NYCU商标会让外界混淆。并再次强调，两校位于不同地区，阳明交大未在美国提供大学课程。
对此，林奇宏接受本报电访时表示，纽约大学并非正式向阳明交大提告，但阳明交大合校后于美国申请商标，于展示其时纽约大学便提出异议，我方则认为没有道理，因此双方学校都已提交答复，该案从2021年就开始，目前正等待美国专利与商标局作最终裁定。
林奇宏说，两校缩写中间差了一个字母，也没有任何将两校混淆的案例，目前尚不清楚最终裁定的日期，「但就交给法院处理。」
阳明交大则表示，为拓展国际声誉与品牌形象，自2021年2月1日合校后，即展开英文缩写「NYCU」在美国商标注册申请，2022年11月8日获美国专利与商标局初步核准公告，并依规定公告异议期，未料公告期间美国纽约大学以近似商标可能造成混淆提出异议。
阳明交大表示，简称「NYCU」与纽约大学「NYU」之间具有清楚辨识性，不易造成混淆或误认，已提出正式书面答辩说明。
